Ingeniero Comercial la Universidad de Chile.
Comenzó su trayectoria política en 1972 al incorporarse a la Izquierda Cristiana (IC), que integraba la Unidad Popular que gobernaba con Salvador Allende.
En 1981 sufrió la detención por parte de la Central Nacional de Informaciones (CNI), donde fue secuestrado y torturado por 10 días; en 1982 nuevamente fue detenido por motivos políticos y condenado a 541 días en la cárcel. En abril de 2015 la Corte Suprema ratificó la sentencia que condenó a 5 agentes de la CNI por torturas aplicadas al actual diputado.
Desde 1989 ha sido reelecto como diputado por Talca. Renunció al PS tras profundas diferencias con dirigentes del partido. En 2012 junto a otros movimientos se une a la Izquierda Ciudadana, uno de los 7 partidos que forman la Nueva Mayoría.
Aguiló es casado con Nivia Palma y tiene tres hijos.